保稅核注清單是金關(guān)二期保稅底賬核注的專用單證，屬于辦理加工貿(mào)易及保稅監(jiān)管業(yè)務(wù)的相關(guān)單證。在辦理貨物進出境、進出海關(guān)特殊監(jiān)管區(qū)域、保稅監(jiān)管場所，以及開展海關(guān)特殊監(jiān)管區(qū)域、保稅監(jiān)管場所、加工貿(mào)易企業(yè)間保稅貨物流（結(jié)）轉(zhuǎn)業(yè)務(wù)的，相關(guān)企業(yè)應(yīng)向海關(guān)報送保稅核注清單數(shù)據(jù)信息，再根據(jù)實際業(yè)務(wù)需要辦理報關(guān)手續(xù)。

海關(guān)對核注清單轉(zhuǎn)報關(guān)單的要求:
1.對于不涉證、不涉稅、不涉及貿(mào)易統(tǒng)計的非實際進出境保稅貨物（如余料結(jié)轉(zhuǎn)），不再進行報關(guān)申報；（包括加貿(mào)的余料結(jié)轉(zhuǎn)、貨物銷毀（處置后未獲得收入）、不作價設(shè)備結(jié)轉(zhuǎn)手續(xù)）海關(guān)審核通過后，系統(tǒng)自動通過保稅核注清單進行保稅底賬核注。
2.對于涉證、涉稅、涉及貿(mào)易統(tǒng)計的實際進出境保稅貨物，企業(yè)在申報保稅核注清單后，由企業(yè)將保稅核注清單數(shù)據(jù)歸并生成報關(guān)單（備案清單）申報數(shù)據(jù)向海關(guān)申報。通關(guān)部門對報關(guān)單審核通過后，與報關(guān)單對應(yīng)的保稅核注清單自動核注保稅底賬。

核注清單歸并生成報關(guān)單的方法：

1.一對一

核注清單商品不進行歸并，與報關(guān)單商品一 一對應(yīng)。這樣做的好處就是：操作簡單，數(shù)據(jù)對應(yīng)清晰。
注：受報關(guān)單商品50項的限制，所以核注清單與報關(guān)單的份數(shù)會增加，導(dǎo)致企業(yè)的通關(guān)成本上升；

2.歸并申報
對商品進行合并：
（1）核注清單是三項商品，根據(jù)海關(guān)五同原則合并成報關(guān)單中的一項商品，企業(yè)將報關(guān)單商品序號填寫為一樣，那就是把按規(guī)則合并為一項。
（2）當(dāng)然將核注清單中的商品進行歸并時，是有要求的。
（3）因為合并后的商品規(guī)格型號只取第一項商品的信息（會造成查驗的時候?qū)?yīng)不上，穿行測試找不回來數(shù)據(jù)）

海關(guān)歸并（清單轉(zhuǎn)報關(guān)單）要求有：
1.核注清單的商品信息必須符合海關(guān)五同的原則，商品編碼、申報計量單位、商品名稱、幣制、原產(chǎn)國/目的國相同；
2.一份清單只能對應(yīng)一份報關(guān)單，所以歸并后報關(guān)單商品項數(shù)不能超過50項。
3.企業(yè)應(yīng)加入的其他歸并要求（清單轉(zhuǎn)報關(guān)單）:
(1)法檢與非法檢、3C、疫區(qū)的商品分成多份單：新報關(guān)單分開申報，可以減少企業(yè)填寫非法檢商品信息；
(2)需要用 [系統(tǒng)] 把歸并過程全部記錄下來（否則這次歸這個商品，下次歸那個商品，穿行測試的時候找不回來）。

進出口報關(guān)流程注意事項：
1）數(shù)據(jù)關(guān)聯(lián)：核注清單做為報關(guān)單的一份隨附單證進行關(guān)聯(lián)使用；且報關(guān)單成功結(jié)關(guān)后，核注清單才會核扣底賬；刪改單必須同步（現(xiàn)已經(jīng)在試點網(wǎng)上作業(yè)）；
2）確保通關(guān)數(shù)據(jù)的準確：核注清單與報關(guān)單都要準確！尤其是出口報關(guān)時的版本號、申報要素等數(shù)據(jù)的準確申報；
3）加強報關(guān)過程的協(xié)調(diào)作業(yè)：企業(yè)需與報關(guān)服務(wù)公司申報的數(shù)據(jù)、過程進行協(xié)調(diào)作業(yè)，減少通關(guān)數(shù)據(jù)的修改，刪單、改單、退單等。

新的海關(guān)AEO認證信用管理辦法出臺后，就明確講到報關(guān)行的原因?qū)е缕髽I(yè)發(fā)生的刪、改、退單，不光影響到報關(guān)行，同時也影響到企業(yè)，同步要扣分的。

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