2018年初，海關(guān)總署發(fā)布19號公告，將“以企業(yè)為單元的加工貿(mào)易新監(jiān)管模式”從9個關(guān)區(qū)擴(kuò)大到26個關(guān)區(qū)，并明確指出各試點(diǎn)海關(guān)統(tǒng)一適用全國統(tǒng)一版的信息化系統(tǒng)開展試點(diǎn)。隨后海關(guān)又發(fā)布23號公告，從2018年7月1日起啟用“核注清單”，即金關(guān)二期保稅底賬核注的專用單證。海關(guān)總署發(fā)布署企發(fā)[2019]4號文件，2019年1月15日全面啟動金關(guān)二期，“金關(guān)二期新賬冊”及“核注清單”的應(yīng)用，標(biāo)志著金關(guān)二期系統(tǒng)正式啟動。
保稅核注清單是金關(guān)二期保稅底賬核注的專用單證，屬于辦理加工貿(mào)易及保稅監(jiān)管業(yè)務(wù)的相關(guān)單證。在辦理貨物進(jìn)出境、進(jìn)出海關(guān)特殊監(jiān)管區(qū)域、保稅監(jiān)管場所，以及開展海關(guān)特殊監(jiān)管區(qū)域、保稅監(jiān)管場所、加工貿(mào)易企業(yè)間保稅貨物流（結(jié)）轉(zhuǎn)業(yè)務(wù)的，相關(guān)企業(yè)應(yīng)向海關(guān)報送保稅核注清單數(shù)據(jù)信息，再根據(jù)實(shí)際業(yè)務(wù)需要辦理報關(guān)手續(xù)。
核注清單的作用：
保稅核注清單是金關(guān)二期保稅底賬核注的專用單證，屬于辦理加工貿(mào)易及保稅監(jiān)管業(yè)務(wù)的相關(guān)單證。簡單說所有進(jìn)出口通關(guān)業(yè)務(wù)類型都要用到核注清單；但不是所有核注清單都要轉(zhuǎn)成報關(guān)單.
核注清單與報關(guān)單的區(qū)別與聯(lián)系：
主要區(qū)別在商品上：前者是反應(yīng)企業(yè)生產(chǎn)實(shí)際的料號級商品；后者是用于通關(guān)、料料號級數(shù)據(jù)經(jīng)過歸并匯總的項號級商品，兩級數(shù)據(jù)需要保持一致。
其他方面的區(qū)別：
（1）用途不同：金關(guān)二期核注清單用于保稅賬冊底賬核扣；報關(guān)單用于辦理相關(guān)稅費(fèi)及貿(mào)易統(tǒng)計；
（2） 申報要求不同：
金關(guān)二期核注清單的申報要求為：
①不申報完整的申報要素；
②不申報運(yùn)輸工具信息；
③不上傳隨附單據(jù)。
金關(guān)二期報關(guān)單的申報要求為；
①需申報完整的申報要素；
②需申報運(yùn)輸工具信息；
③需上傳隨附單據(jù)，如裝箱單、發(fā)票。
（3）表體商品項數(shù)不同：核注清單<1000項；報關(guān)單<50項.
核注清單和報關(guān)單的數(shù)量關(guān)系是一對一（需要報關(guān)）或一對零（不需要報關(guān)）。清單必須有保稅底賬與之對應(yīng)，底賬可以為賬冊、手冊等。
核注清單申報注意事項：
1.保稅貨物流轉(zhuǎn)業(yè)務(wù)的，流轉(zhuǎn)雙方企業(yè)分別向海關(guān)發(fā)送保稅核注清單數(shù)據(jù)，由系統(tǒng)自動對保稅核注清單數(shù)據(jù)進(jìn)行比對、核扣；
2.申報保稅核注清單后需辦理報關(guān)手續(xù)的，保稅核注清單作為報關(guān)單的隨附單證，與報關(guān)單一一對應(yīng)；
3.系統(tǒng)提供歸并輔助功能，企業(yè)可進(jìn)行修改。需要報關(guān)的貨物，保稅核注清單中必須填寫報關(guān)單序號，以便報關(guān)單系統(tǒng)做邏輯檢查；
4.保稅核注清單的邏輯檢查、填制要求基本與現(xiàn)行報關(guān)單、進(jìn)出境備案清單要求相同。
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